A missão da Agrosuisse é prestar serviço de excelência em consultoria nas diversas áreas de competência relacionadas com o sistema agroalimentar incluindo as vertentes da produção agropecuária, agroindústria e seu papel na segurança alimentar e nutricional e desenvolvimento territorial sustentável.
Para o alcance desta missão, privilegia uma atualização permanente e recursos humanos altamente qualificados, além de uma estratégia de intervenção lastreada nos seguintes valores: